MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 5057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011982	TA	3	6	178326	178331	50 %	50 %	0 %	0 %	222080255
3502	NC_011982	TAT	2	6	178352	178357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080255
3503	NC_011982	A	6	6	178391	178396	100 %	0 %	0 %	0 %	222080255
3504	NC_011982	GATC	2	8	178523	178530	25 %	25 %	25 %	25 %	222080255
3505	NC_011982	TAG	2	6	178555	178560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080255
3506	NC_011982	TA	3	6	178577	178582	50 %	50 %	0 %	0 %	222080255
3507	NC_011982	TGG	2	6	178610	178615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080255
3508	NC_011982	GAT	2	6	178619	178624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080255
3509	NC_011982	CTGA	2	8	178793	178800	25 %	25 %	25 %	25 %	222080255
3510	NC_011982	TCT	2	6	178837	178842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080255
3511	NC_011982	TCT	2	6	178937	178942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080255
3512	NC_011982	TCG	2	6	178954	178959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
3513	NC_011982	CGT	2	6	178976	178981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
3514	NC_011982	AT	3	6	178999	179004	50 %	50 %	0 %	0 %	222080255
3515	NC_011982	CAT	2	6	179031	179036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
3516	NC_011982	GGA	2	6	179082	179087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080256
3517	NC_011982	CTC	2	6	179158	179163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080256
3518	NC_011982	CTC	2	6	179182	179187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080256
3519	NC_011982	CTC	2	6	179345	179350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_011982	ACAA	2	8	179414	179421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_011982	ATC	2	6	179626	179631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_011982	TGA	2	6	179677	179682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011982	GCG	2	6	179790	179795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011982	CGA	2	6	179800	179805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_011982	GGA	2	6	179807	179812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011982	TCT	2	6	179827	179832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_011982	GCT	2	6	179874	179879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011982	CTT	2	6	179979	179984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_011982	GGC	2	6	180029	180034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_011982	GCCAAG	2	12	180053	180064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011982	GCC	2	6	180167	180172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_011982	CTG	2	6	180216	180221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_011982	GC	4	8	180231	180238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_011982	GAA	2	6	180301	180306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011982	TTG	2	6	180401	180406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011982	CGC	2	6	180464	180469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_011982	GCA	2	6	180677	180682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_011982	GTCT	2	8	180788	180795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_011982	CTGA	2	8	180821	180828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_011982	CGG	2	6	180992	180997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_011982	CGG	2	6	181070	181075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_011982	TTGC	2	8	181100	181107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_011982	ACC	2	6	181123	181128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_011982	TTGA	2	8	181136	181143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011982	AGG	2	6	181147	181152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011982	GTGAA	2	10	181164	181173	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011982	GCGG	2	8	181183	181190	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_011982	AAG	2	6	181293	181298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011982	GCG	2	6	181368	181373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011982	GCT	2	6	181417	181422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_011982	GCT	2	6	181453	181458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_011982	GTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011982	CG	3	6	181615	181620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_011982	GCG	2	6	181697	181702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011982	ACG	2	6	181706	181711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_011982	CGC	2	6	181900	181905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_011982	GAG	2	6	181923	181928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_011982	GCG	2	6	182275	182280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080257
3559	NC_011982	GGC	2	6	182292	182297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011982	GTCG	2	8	182431	182438	0 %	25 %	50 %	25 %	222080258
3561	NC_011982	GCA	2	6	182444	182449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3562	NC_011982	TGG	2	6	182469	182474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
3563	NC_011982	GC	3	6	182548	182553	0 %	0 %	50 %	50 %	222080258
3564	NC_011982	GCC	2	6	182651	182656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3565	NC_011982	CAAT	2	8	182682	182689	50 %	25 %	0 %	25 %	222080258
3566	NC_011982	GC	3	6	182864	182869	0 %	0 %	50 %	50 %	222080258
3567	NC_011982	CCGA	2	8	182972	182979	25 %	0 %	25 %	50 %	222080258
3568	NC_011982	G	6	6	183062	183067	0 %	0 %	100 %	0 %	222080258
3569	NC_011982	CGGT	2	8	183122	183129	0 %	25 %	50 %	25 %	222080258
3570	NC_011982	GAC	2	6	183187	183192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3571	NC_011982	AAGACG	2	12	183221	183232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222080258
3572	NC_011982	TGC	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3573	NC_011982	GAC	2	6	183257	183262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3574	NC_011982	GGTGT	2	10	183290	183299	0 %	40 %	60 %	0 %	222080258
3575	NC_011982	GCC	2	6	183332	183337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3576	NC_011982	GGT	2	6	183383	183388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
3577	NC_011982	GCG	2	6	183420	183425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080258
3578	NC_011982	TGA	2	6	183508	183513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080258
3579	NC_011982	CGC	2	6	183529	183534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3580	NC_011982	TCG	2	6	183580	183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3581	NC_011982	TGG	2	6	183615	183620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
3582	NC_011982	TTC	2	6	183626	183631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080258
3583	NC_011982	GAC	2	6	183734	183739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
3584	NC_011982	TGG	2	6	183765	183770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
3585	NC_011982	CCG	2	6	183781	183786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3586	NC_011982	CCG	2	6	183799	183804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3587	NC_011982	AATG	2	8	183880	183887	50 %	25 %	25 %	0 %	222080258
3588	NC_011982	GCC	2	6	183983	183988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
3589	NC_011982	TCG	2	6	184023	184028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_011982	CGC	2	6	184100	184105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_011982	CGG	2	6	184109	184114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011982	A	6	6	184372	184377	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
3593	NC_011982	TCCC	2	8	184386	184393	0 %	25 %	0 %	75 %	222080259
3594	NC_011982	CCG	2	6	184397	184402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
3595	NC_011982	CAA	2	6	184430	184435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080259
3596	NC_011982	TGA	2	6	184436	184441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
3597	NC_011982	ATC	2	6	184603	184608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
3598	NC_011982	ACC	2	6	184645	184650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080259
3599	NC_011982	TC	3	6	184658	184663	0 %	50 %	0 %	50 %	222080259
3600	NC_011982	TTC	2	6	184679	184684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
3601	NC_011982	A	7	7	184692	184698	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
3602	NC_011982	GCT	2	6	184715	184720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
3603	NC_011982	AGT	2	6	184857	184862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
3604	NC_011982	GAA	2	6	184863	184868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
3605	NC_011982	AAG	2	6	184929	184934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
3606	NC_011982	CTT	2	6	184996	185001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
3607	NC_011982	TCA	2	6	185060	185065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
3608	NC_011982	CAACC	2	10	185148	185157	40 %	0 %	0 %	60 %	222080259
3609	NC_011982	ACG	2	6	185162	185167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
3610	NC_011982	TGT	2	6	185208	185213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080259
3611	NC_011982	ATG	2	6	185281	185286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
3612	NC_011982	CGG	2	6	185314	185319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080259
3613	NC_011982	TGT	2	6	185369	185374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080259
3614	NC_011982	GCC	2	6	185391	185396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
3615	NC_011982	ACG	2	6	185439	185444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
3616	NC_011982	TTGC	2	8	185466	185473	0 %	50 %	25 %	25 %	222080259
3617	NC_011982	AC	3	6	185497	185502	50 %	0 %	0 %	50 %	222080259
3618	NC_011982	GCC	2	6	185506	185511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
3619	NC_011982	CGG	2	6	185541	185546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080259
3620	NC_011982	AGC	2	6	185648	185653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
3621	NC_011982	CCCG	2	8	185684	185691	0 %	0 %	25 %	75 %	222080259
3622	NC_011982	CTC	2	6	185694	185699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080259
3623	NC_011982	CGT	2	6	185731	185736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
3624	NC_011982	GGA	2	6	185752	185757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080259
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3626	NC_011982	CTA	2	6	185801	185806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
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